Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBP1Q9NZI7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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UBP1Q9NZI7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBP1Q9NZI7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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