Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPG21Q9NZD8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPG21Q9NZD8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms