Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COMMD8Q9NX08 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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