Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMEM140Q9NV12 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TMEM140Q9NV12 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms