Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
NIT2Q9NQR4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NIT2Q9NQR4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms