Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX2Q9NPC8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SIX2Q9NPC8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms