Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNRC6CQ9HCJ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TNRC6CQ9HCJ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNRC6CQ9HCJ0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms