Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL3Q9H2J4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL3Q9H2J4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms