Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C20orf27Q9GZN8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
C20orf27Q9GZN8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms