Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZC3H12CQ9C0D7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZC3H12CQ9C0D7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms