Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF7Q9BWX1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHF7Q9BWX1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms