Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C2orf88Q9BSF0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms