Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VAT1Q99536 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VAT1Q99536 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms