Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SORT1Q99523 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SORT1Q99523 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms