Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD1Q99460 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD1Q99460 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms