Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
LMTK3Q96Q04 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
LMTK3Q96Q04 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms