Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GBP4Q96PP9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GBP4Q96PP9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms