Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
JSRP1Q96MG2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JSRP1Q96MG2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms