Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
PRRC1Q96M27 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PRRC1Q96M27 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms