Protein–RNA interactions for Protein: Q96G28

CFAP36, Cilia- and flagella-associated protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP36Q96G28 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CFAP36Q96G28 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
CFAP36Q96G28 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms