Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MRPL53Q96EL3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms