Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLP1Q92989 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLP1Q92989 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms