Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEU8

APPL2, DCC-interacting protein 13-beta, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL2Q8NEU8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APPL2Q8NEU8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APPL2Q8NEU8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms