Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF548Q8NEK5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNF548Q8NEK5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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