Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SVBPQ8N300 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVBPQ8N300 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms