Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMTR1Q8N1G2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMTR1Q8N1G2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms