Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 ADK-204ENST00000478611 443 ntTSL 311.67□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PTTG1IP-207ENST00000494690 612 ntTSL 511.65□□□□□ -0.545e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 311.63□□□□□ -0.555e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 411.55□□□□□ -0.565e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AKT1-202ENST00000402615 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-206ENST00000423252 644 ntTSL 511.46□□□□□ -0.575e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-201ENST00000361188 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MON2-207ENST00000549286 424 ntTSL 511.4□□□□□ -0.585e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-210ENST00000548258 550 ntTSL 511.39□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CLASP2-209ENST00000468888 6978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.595e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LRIF1-201ENST00000369763 3475 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-220ENST00000488074 759 ntTSL 311.3□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-207ENST00000484547 1596 ntTSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LIG3-213ENST00000590630 904 ntTSL 511.29□□□□□ -0.65e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-218ENST00000475144 519 ntTSL 211.27□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRKCB-207ENST00000486868 467 ntTSL 311.25□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 API5-201ENST00000378852 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.615e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 311.21□□□□□ -0.611e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPR-204ENST00000371059 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SCAMP3-203ENST00000462151 819 ntTSL 511.14□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AL662899.3-202ENST00000617558 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RFX5-206ENST00000422595 902 ntTSL 511.09□□□□□ -0.635e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-208ENST00000510829 3553 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LARS2-202ENST00000414984 2800 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TSPYL4-201ENST00000420283 4180 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.645e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PSTPIP2-204ENST00000589328 2900 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 510.97□□□□□ -0.655e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZDHHC7-206ENST00000569017 483 ntTSL 410.95□□□□□ -0.665e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PRC1-202ENST00000394249 3034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.675e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.685e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KMT5C-209ENST00000587442 464 ntTSL 310.72□□□□□ -0.695e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CABIN1-214ENST00000617531 7072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.71e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-208ENST00000481269 785 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TBC1D14-207ENST00000448507 4887 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NSL1-206ENST00000626725 790 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.715e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CATSPER2-203ENST00000396879 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.725e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LINC01033-201ENST00000504609 735 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CSNK2B-204ENST00000375885 1061 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CCND2-201ENST00000261254 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SMYD3-203ENST00000391836 732 ntTSL 510.46□□□□□ -0.735e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.46□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LIG3-201ENST00000262327 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-204ENST00000562776 590 ntTSL 410.35□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PHYKPL-216ENST00000510991 814 ntTSL 310.35□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-213ENST00000636847 5538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.755e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-214ENST00000570115 554 ntTSL 410.29□□□□□ -0.765e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZMIZ1-204ENST00000478357 4252 ntTSL 210.24□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-202ENST00000449913 3062 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LEPROT-204ENST00000488747 345 ntTSL 510.21□□□□□ -0.775e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BANP-222ENST00000526460 547 ntTSL 410.17□□□□□ -0.785e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-212ENST00000521610 580 ntTSL 410.12□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-201ENST00000360439 5050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.795e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-205ENST00000450873 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 81.8
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SUPV3L1Q8IYB8 RPS10-NUDT3-203ENST00000639877 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.85e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LARS2-203ENST00000415258 4744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.815e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.825e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.835e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LARS2-201ENST00000265537 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.845e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CATSPER2-208ENST00000433380 1468 ntTSL 1 (best)9.76□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-211ENST00000494079 854 ntTSL 39.72□□□□□ -0.855e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-203ENST00000378814 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.865e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 39.61□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ZNF621-206ENST00000462161 536 ntTSL 39.6□□□□□ -0.875e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GRIPAP1-209ENST00000611757 3255 ntTSL 29.57□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AL117329.1-201ENST00000423737 1815 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.885e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 TP53BP1-204ENST00000411772 3976 ntTSL 59.48□□□□□ -0.895e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 SIN3A-205ENST00000564778 617 ntTSL 29.44□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 HDAC2-210ENST00000521163 557 ntTSL 59.43□□□□□ -0.95e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 GPR162-205ENST00000541431 776 ntTSL 39.39□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-205ENST00000505253 676 ntTSL 39.34□□□□□ -0.915e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 MARCH6-204ENST00000503788 2874 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.925e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-209ENST00000547761 827 ntTSL 59.26□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AAAS-208ENST00000547757 949 ntTSL 29.26□□□□□ -0.931e-8■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPP2R2A-202ENST00000380737 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RIMKLB-212ENST00000544257 1589 ntTSL 1 (best)9.18□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FAM133B-202ENST00000427372 931 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.945e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.965e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 AGPAT5-202ENST00000518327 852 ntTSL 1 (best)9.02□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PPM1F-206ENST00000484588 348 ntTSL 59.01□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 RABGEF1-201ENST00000284957 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.975e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.985e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ARID1B-205ENST00000414678 6528 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.89□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 38.88□□□□□ -0.991e-7■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 NBPF11-201ENST00000613531 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.86□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 ANK3-205ENST00000373827 7202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
SUPV3L1Q8IYB8 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 81.8
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