Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC83Q8IWF9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC83Q8IWF9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms