Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SKAP1Q86WV1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms