Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNA2D4Q7Z3S7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms