Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATG9AQ7Z3C6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATG9AQ7Z3C6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms