Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NLRP9Q7RTR0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NLRP9Q7RTR0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms