Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP50Q70EL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP50Q70EL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
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