Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM43BQ6ZT52 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM43BQ6ZT52 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms