Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC137Q6PK04 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC137Q6PK04 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms