Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A1Q6PCB7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A1Q6PCB7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC27A1Q6PCB7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC27A1Q6PCB7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms