Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
LMOD2Q6P5Q4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LMOD2Q6P5Q4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms