Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPATA1Q5VX52 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA1Q5VX52 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms