Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC183Q5T5S1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC183Q5T5S1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms