Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
AKAP4Q5JQC9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AKAP4Q5JQC9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AKAP4Q5JQC9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms