Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
XKR3Q5GH77 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
XKR3Q5GH77 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms