Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC178Q5BJE1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC178Q5BJE1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms