Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CEP55Q53EZ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP55Q53EZ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms