Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXF1

FAM74A3, Putative protein FAM74A3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A3Q4VXF1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FAM74A3Q4VXF1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM74A3Q4VXF1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms