Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM71Q2Q1W2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms