Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MICAQ29983 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MICAQ29983 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MICAQ29983 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MICAQ29983 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MICAQ29983 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MICAQ29983 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
MICAQ29983 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms