Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSPP1Q1MSJ5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSPP1Q1MSJ5 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms