Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FSCN1Q16658 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FSCN1Q16658 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms