Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GRIK5Q16478 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GRIK5Q16478 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
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