Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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